Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms