Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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