Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P5

Trbv26, T cell receptor beta, variable 26 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv26A0A0B4J1P5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Trbv26A0A0B4J1P5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Trbv26A0A0B4J1P5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Trbv26A0A0B4J1P5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Trbv26A0A0B4J1P5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Trbv26A0A0B4J1P5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms