Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trbv30A0A0B4J1P1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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