Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Rbms3-207ENSMUST00000164018 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm22701-201ENSMUST00000175371 291 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm19035-202ENSMUST00000194575 959 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm43838-201ENSMUST00000196357 348 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm18600-201ENSMUST00000207205 505 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Ankrd6-201ENSMUST00000035719 4683 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Cdh23-202ENSMUST00000105461 11096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Plec-221ENSMUST00000171562 14944 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Plec-204ENSMUST00000072692 14944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Ofcc1-201ENSMUST00000054635 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Irgm1-201ENSMUST00000049519 2259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Impa1-201ENSMUST00000065938 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Chm-201ENSMUST00000026607 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Pcdh15-236ENSMUST00000193174 5936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 B020004J07Rik-202ENSMUST00000106919 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm44669-201ENSMUST00000207774 1969 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm12107-201ENSMUST00000132857 889 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm11551-201ENSMUST00000147438 410 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 1700109G15Rik-201ENSMUST00000150735 384 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm23674-201ENSMUST00000157473 131 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 2610528A11Rik-201ENSMUST00000179488 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm29201-201ENSMUST00000189120 431 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm32005-201ENSMUST00000212446 959 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 n-R5-8s1-201ENSMUST00000083988 148 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Nrxn3-205ENSMUST00000163134 7922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Vmn1r52-203ENSMUST00000227100 2307 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Celsr3-201ENSMUST00000024238 11547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Ccdc18Q640L5 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Pp2d1-201ENSMUST00000056198 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Slitrk4-201ENSMUST00000069926 8494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Rnf43-209ENSMUST00000165679 4310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Cast-202ENSMUST00000220738 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 A130012E19Rik-201ENSMUST00000218674 3135 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Sptbn1-203ENSMUST00000102838 9107 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Olfr97-206ENSMUST00000216225 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Zfp661-202ENSMUST00000110366 4912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Kat6b-203ENSMUST00000112458 997 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 4930527B05Rik-201ENSMUST00000141593 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm27210-201ENSMUST00000184263 402 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm45448-201ENSMUST00000211739 209 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 AC163651.1-201ENSMUST00000222500 372 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Ctnnd1-211ENSMUST00000111685 5985 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Myot-202ENSMUST00000115498 2087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Pcsk2os1-201ENSMUST00000126735 4233 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Cpsf2-201ENSMUST00000047357 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Rgs7-201ENSMUST00000027812 1418 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Txlnb-201ENSMUST00000037964 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Mep1a-202ENSMUST00000117137 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Rad21-201ENSMUST00000022927 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm45904-201ENSMUST00000213082 2330 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Olfr766-ps1-201ENSMUST00000204515 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Alms1-205ENSMUST00000213058 11163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm46123-201ENSMUST00000217447 6424 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm14002-201ENSMUST00000123574 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Prickle2-201ENSMUST00000032093 7754 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Mapk10-206ENSMUST00000133069 2732 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Rps12-ps20-201ENSMUST00000121168 402 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm25550-201ENSMUST00000158079 128 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm27255-201ENSMUST00000184303 529 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Mir7037-201ENSMUST00000184414 65 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm3351-201ENSMUST00000193454 505 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm31698-203ENSMUST00000217115 690 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
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