Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Abca8a-202ENSMUST00000100287 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Abca8a-204ENSMUST00000106664 5617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Gm6181-201ENSMUST00000117187 264 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Gm43846-201ENSMUST00000200502 932 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Helz2-201ENSMUST00000094203 9162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Gm16487-201ENSMUST00000105048 4037 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Trim66-203ENSMUST00000106741 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Nkap-201ENSMUST00000016553 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Vmn2r12-201ENSMUST00000095922 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Golph3l-202ENSMUST00000098861 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Bdnf-202ENSMUST00000111042 3905 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Pcsk2-201ENSMUST00000028905 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Epn2-213ENSMUST00000179936 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Ugt2b34-201ENSMUST00000031181 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Gm11853-201ENSMUST00000119687 1384 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Sap130-201ENSMUST00000025109 4015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Fbxw10-203ENSMUST00000150989 3267 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Olfr1069-ps1-201ENSMUST00000120755 965 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Gm24065-201ENSMUST00000157487 264 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Gm18467-201ENSMUST00000208805 434 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 FAM237A-201ENSMUST00000226288 1105 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 2610203C22Rik-204ENSMUST00000148585 3475 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Pcdhb3-201ENSMUST00000051754 3787 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Ccnyl1-201ENSMUST00000094898 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Gm7970-201ENSMUST00000167615 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Gm8229-201ENSMUST00000168161 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 9930014A18Rik-202ENSMUST00000181910 4116 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 AC132232.1-201ENSMUST00000214667 1019 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Ccdc150-201ENSMUST00000027128 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 6720489N17Rik-203ENSMUST00000223338 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Gm14252-201ENSMUST00000131801 3215 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Kcnab1-201ENSMUST00000049230 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 9030624J02Rik-201ENSMUST00000033280 2934 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Enox2-204ENSMUST00000114914 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Lama5-201ENSMUST00000015791 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Ehmt1-204ENSMUST00000114418 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Nrxn3-201ENSMUST00000057634 4634 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Gm43519-201ENSMUST00000197239 1872 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Kcnmb2-204ENSMUST00000191869 1552 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Vmn2r120-201ENSMUST00000165781 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Mir700-201ENSMUST00000102169 79 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Gm13428-201ENSMUST00000117540 365 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 4930512P04Rik-201ENSMUST00000197000 424 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Olfr1360-202ENSMUST00000205788 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Lars2-201ENSMUST00000038863 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Tubgcp5-201ENSMUST00000032627 3905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Rpgr-206ENSMUST00000115534 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Scfd2-201ENSMUST00000072857 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Hipk2-205ENSMUST00000160962 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Mpzl3-203ENSMUST00000114664 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Cdc14b-202ENSMUST00000109769 2886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Setd1bQ8CFT2 Gm43533-201ENSMUST00000202933 2936 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms