Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxw7-202ENSMUST00000107675 3599 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Trim43c-201ENSMUST00000163255 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Cflar-205ENSMUST00000114313 6572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Plag1-201ENSMUST00000003369 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Depdc5-204ENSMUST00000119705 7929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28289-201ENSMUST00000189331 315 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17834-201ENSMUST00000204322 891 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 AC079644.2-201ENSMUST00000220581 322 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37410-201ENSMUST00000193623 3039 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Tmprss11g-201ENSMUST00000134179 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Dst-209ENSMUST00000182697 2704 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Prkaa1-202ENSMUST00000228218 4618 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr12-202ENSMUST00000213247 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15448-203ENSMUST00000108620 1828 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp3cc-203ENSMUST00000228911 1836 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem161b-201ENSMUST00000057495 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6509-202ENSMUST00000201552 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Slc37a3-201ENSMUST00000090243 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15596-201ENSMUST00000121139 784 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Prlr-204ENSMUST00000128450 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10130-201ENSMUST00000133235 303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7651-201ENSMUST00000173398 901 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 4930568G15Rik-202ENSMUST00000195635 996 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Tshb-205ENSMUST00000197322 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 1700021G15Rik-201ENSMUST00000217671 528 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr922-201ENSMUST00000051004 1132 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Med1-201ENSMUST00000018304 5845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm28333-201ENSMUST00000186034 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28718-201ENSMUST00000188417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28977-201ENSMUST00000188678 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28315-201ENSMUST00000189948 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29612-201ENSMUST00000191490 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 4930402H24Rik-201ENSMUST00000044766 6628 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb18-206ENSMUST00000193480 3734 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Psg22-202ENSMUST00000108481 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Psg22-203ENSMUST00000208221 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Psg22-201ENSMUST00000051973 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxl5-203ENSMUST00000114047 2762 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
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Ccdc88cQ6VGS5 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28109-201ENSMUST00000189979 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 1700086P04Rik-201ENSMUST00000149472 1009 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
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Ccdc88cQ6VGS5 Oas2-201ENSMUST00000053909 3869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
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Ccdc88cQ6VGS5 Cabyr-204ENSMUST00000121018 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp2j7-201ENSMUST00000162514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Akap2-207ENSMUST00000107600 7231 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp207-203ENSMUST00000108216 2152 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Apc-ps1-201ENSMUST00000119356 470 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23018-201ENSMUST00000177928 109 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Mir6908-201ENSMUST00000184056 63 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Fcer1a-202ENSMUST00000193017 826 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl28-ps2-201ENSMUST00000194739 554 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm32884-201ENSMUST00000205528 732 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13304-201ENSMUST00000098123 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms