Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2S7

Tsc22d3, TSC22 domain family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d3Q9Z2S7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsc22d3Q9Z2S7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsc22d3Q9Z2S7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsc22d3Q9Z2S7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsc22d3Q9Z2S7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsc22d3Q9Z2S7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsc22d3Q9Z2S7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsc22d3Q9Z2S7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsc22d3Q9Z2S7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsc22d3Q9Z2S7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsc22d3Q9Z2S7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsc22d3Q9Z2S7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsc22d3Q9Z2S7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsc22d3Q9Z2S7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsc22d3Q9Z2S7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsc22d3Q9Z2S7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsc22d3Q9Z2S7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsc22d3Q9Z2S7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsc22d3Q9Z2S7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsc22d3Q9Z2S7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsc22d3Q9Z2S7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsc22d3Q9Z2S7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms