Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Robo3Q9Z2I4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Robo3Q9Z2I4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms