Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNX9Q9Y5X1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX9Q9Y5X1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms