Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUT7

Ccr9, C-C chemokine receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr9Q9WUT7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr9Q9WUT7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr9Q9WUT7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr9Q9WUT7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr9Q9WUT7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr9Q9WUT7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr9Q9WUT7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr9Q9WUT7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr9Q9WUT7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr9Q9WUT7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr9Q9WUT7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr9Q9WUT7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr9Q9WUT7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr9Q9WUT7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr9Q9WUT7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr9Q9WUT7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr9Q9WUT7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr9Q9WUT7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr9Q9WUT7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr9Q9WUT7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr9Q9WUT7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr9Q9WUT7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr9Q9WUT7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr9Q9WUT7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr9Q9WUT7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr9Q9WUT7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr9Q9WUT7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr9Q9WUT7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr9Q9WUT7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr9Q9WUT7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr9Q9WUT7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr9Q9WUT7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr9Q9WUT7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms