Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Psma4Q9R1P0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms