Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcl11aQ9QYE3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms