Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Psma6Q9QUM9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms