Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL13Q9P2N7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms