Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms