Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI74

Klhl1, Kelch-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl1Q9JI74 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl1Q9JI74 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms