Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms