Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms