Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C2

Tspan13, Tetraspanin-13, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan13Q9D8C2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tspan13Q9D8C2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tspan13Q9D8C2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tspan13Q9D8C2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tspan13Q9D8C2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tspan13Q9D8C2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tspan13Q9D8C2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tspan13Q9D8C2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tspan13Q9D8C2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tspan13Q9D8C2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tspan13Q9D8C2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tspan13Q9D8C2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan13Q9D8C2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan13Q9D8C2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan13Q9D8C2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan13Q9D8C2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan13Q9D8C2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan13Q9D8C2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan13Q9D8C2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan13Q9D8C2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan13Q9D8C2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan13Q9D8C2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan13Q9D8C2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan13Q9D8C2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan13Q9D8C2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan13Q9D8C2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan13Q9D8C2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan13Q9D8C2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tspan13Q9D8C2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan13Q9D8C2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan13Q9D8C2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan13Q9D8C2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan13Q9D8C2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan13Q9D8C2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan13Q9D8C2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tspan13Q9D8C2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms