Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rep15Q9D7T1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rep15Q9D7T1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rep15Q9D7T1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rep15Q9D7T1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms