Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms