Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed11Q9D2R4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmed11Q9D2R4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmed11Q9D2R4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmed11Q9D2R4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmed11Q9D2R4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmed11Q9D2R4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmed11Q9D2R4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed11Q9D2R4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed11Q9D2R4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed11Q9D2R4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed11Q9D2R4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed11Q9D2R4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms