Protein–RNA interactions for Protein: Q9D103

Ifitm1, Interferon-induced transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm1Q9D103 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifitm1Q9D103 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms