Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms