Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWR2

Smyd3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd3Q9CWR2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Smyd3Q9CWR2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smyd3Q9CWR2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smyd3Q9CWR2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Smyd3Q9CWR2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Smyd3Q9CWR2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Smyd3Q9CWR2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smyd3Q9CWR2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smyd3Q9CWR2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smyd3Q9CWR2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smyd3Q9CWR2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smyd3Q9CWR2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smyd3Q9CWR2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smyd3Q9CWR2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smyd3Q9CWR2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smyd3Q9CWR2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smyd3Q9CWR2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smyd3Q9CWR2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smyd3Q9CWR2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Smyd3Q9CWR2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms