Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ykt6Q9CQW1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms