Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc2Q9CQP2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc2Q9CQP2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms