Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms