Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cstf3Q99LI7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cstf3Q99LI7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms