Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GatbQ99JT1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms