Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms