Protein–RNA interactions for Protein: Q924C5

Alpk3, Alpha-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk3Q924C5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Alpk3Q924C5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Alpk3Q924C5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Alpk3Q924C5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Alpk3Q924C5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Alpk3Q924C5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Alpk3Q924C5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Alpk3Q924C5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Alpk3Q924C5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Alpk3Q924C5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Alpk3Q924C5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Alpk3Q924C5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Alpk3Q924C5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Alpk3Q924C5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Alpk3Q924C5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Alpk3Q924C5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Alpk3Q924C5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Alpk3Q924C5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Alpk3Q924C5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Alpk3Q924C5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Alpk3Q924C5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Alpk3Q924C5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Alpk3Q924C5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Alpk3Q924C5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Alpk3Q924C5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Alpk3Q924C5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Alpk3Q924C5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Alpk3Q924C5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Alpk3Q924C5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Alpk3Q924C5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Alpk3Q924C5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Alpk3Q924C5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Alpk3Q924C5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Alpk3Q924C5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Alpk3Q924C5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Alpk3Q924C5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Alpk3Q924C5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Alpk3Q924C5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Alpk3Q924C5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Alpk3Q924C5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Alpk3Q924C5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Alpk3Q924C5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Alpk3Q924C5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Alpk3Q924C5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Alpk3Q924C5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Alpk3Q924C5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms