Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ncapd2Q8K2Z4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ncapd2Q8K2Z4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ncapd2Q8K2Z4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms