Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Paf1Q8K2T8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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