Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hacd3Q8K2C9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hacd3Q8K2C9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hacd3Q8K2C9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hacd3Q8K2C9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hacd3Q8K2C9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hacd3Q8K2C9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hacd3Q8K2C9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hacd3Q8K2C9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hacd3Q8K2C9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hacd3Q8K2C9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hacd3Q8K2C9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hacd3Q8K2C9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hacd3Q8K2C9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hacd3Q8K2C9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hacd3Q8K2C9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hacd3Q8K2C9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hacd3Q8K2C9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hacd3Q8K2C9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms