Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prkd3Q8K1Y2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkd3Q8K1Y2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkd3Q8K1Y2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkd3Q8K1Y2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkd3Q8K1Y2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkd3Q8K1Y2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkd3Q8K1Y2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkd3Q8K1Y2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkd3Q8K1Y2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkd3Q8K1Y2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkd3Q8K1Y2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkd3Q8K1Y2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkd3Q8K1Y2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkd3Q8K1Y2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prkd3Q8K1Y2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prkd3Q8K1Y2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prkd3Q8K1Y2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prkd3Q8K1Y2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms