Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Znf428Q8C1M2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Znf428Q8C1M2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf428Q8C1M2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf428Q8C1M2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf428Q8C1M2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf428Q8C1M2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf428Q8C1M2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf428Q8C1M2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf428Q8C1M2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf428Q8C1M2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf428Q8C1M2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf428Q8C1M2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf428Q8C1M2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf428Q8C1M2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf428Q8C1M2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf428Q8C1M2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf428Q8C1M2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf428Q8C1M2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf428Q8C1M2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf428Q8C1M2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf428Q8C1M2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf428Q8C1M2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf428Q8C1M2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf428Q8C1M2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf428Q8C1M2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf428Q8C1M2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms