Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN3

Catsper4, Cation channel sperm-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper4Q8BVN3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Catsper4Q8BVN3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms