Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmco3Q8BH01 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmco3Q8BH01 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmco3Q8BH01 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmco3Q8BH01 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmco3Q8BH01 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmco3Q8BH01 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmco3Q8BH01 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmco3Q8BH01 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmco3Q8BH01 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmco3Q8BH01 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmco3Q8BH01 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmco3Q8BH01 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmco3Q8BH01 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmco3Q8BH01 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmco3Q8BH01 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmco3Q8BH01 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmco3Q8BH01 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmco3Q8BH01 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmco3Q8BH01 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms