Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
U2af1l4Q8BGJ9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
U2af1l4Q8BGJ9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms