Protein–RNA interactions for Protein: Q80X59

Tmco5b, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5B, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5bQ80X59 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmco5bQ80X59 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmco5bQ80X59 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmco5bQ80X59 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmco5bQ80X59 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmco5bQ80X59 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmco5bQ80X59 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmco5bQ80X59 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmco5bQ80X59 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmco5bQ80X59 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmco5bQ80X59 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmco5bQ80X59 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmco5bQ80X59 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmco5bQ80X59 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmco5bQ80X59 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmco5bQ80X59 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmco5bQ80X59 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmco5bQ80X59 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmco5bQ80X59 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmco5bQ80X59 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmco5bQ80X59 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmco5bQ80X59 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tmco5bQ80X59 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tmco5bQ80X59 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tmco5bQ80X59 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmco5bQ80X59 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmco5bQ80X59 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmco5bQ80X59 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmco5bQ80X59 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmco5bQ80X59 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmco5bQ80X59 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmco5bQ80X59 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmco5bQ80X59 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmco5bQ80X59 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmco5bQ80X59 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmco5bQ80X59 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmco5bQ80X59 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmco5bQ80X59 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmco5bQ80X59 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmco5bQ80X59 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmco5bQ80X59 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmco5bQ80X59 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmco5bQ80X59 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmco5bQ80X59 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmco5bQ80X59 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmco5bQ80X59 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmco5bQ80X59 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmco5bQ80X59 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmco5bQ80X59 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmco5bQ80X59 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmco5bQ80X59 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmco5bQ80X59 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmco5bQ80X59 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmco5bQ80X59 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmco5bQ80X59 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmco5bQ80X59 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmco5bQ80X59 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmco5bQ80X59 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmco5bQ80X59 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmco5bQ80X59 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmco5bQ80X59 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmco5bQ80X59 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmco5bQ80X59 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmco5bQ80X59 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmco5bQ80X59 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmco5bQ80X59 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmco5bQ80X59 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmco5bQ80X59 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmco5bQ80X59 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmco5bQ80X59 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmco5bQ80X59 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmco5bQ80X59 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmco5bQ80X59 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmco5bQ80X59 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmco5bQ80X59 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmco5bQ80X59 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmco5bQ80X59 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmco5bQ80X59 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmco5bQ80X59 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmco5bQ80X59 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmco5bQ80X59 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmco5bQ80X59 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmco5bQ80X59 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmco5bQ80X59 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmco5bQ80X59 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmco5bQ80X59 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmco5bQ80X59 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmco5bQ80X59 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmco5bQ80X59 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmco5bQ80X59 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmco5bQ80X59 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmco5bQ80X59 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmco5bQ80X59 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmco5bQ80X59 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmco5bQ80X59 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmco5bQ80X59 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmco5bQ80X59 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmco5bQ80X59 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmco5bQ80X59 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmco5bQ80X59 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms