Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap2lQ7TS74 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ckap2lQ7TS74 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms