Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN29

Smap2, Stromal membrane-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap2Q7TN29 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smap2Q7TN29 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smap2Q7TN29 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms