Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim12Q78RX3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms