Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Higd1cQ76I25 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Higd1cQ76I25 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Higd1cQ76I25 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Higd1cQ76I25 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Higd1cQ76I25 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Higd1cQ76I25 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Higd1cQ76I25 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Higd1cQ76I25 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Higd1cQ76I25 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Higd1cQ76I25 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Higd1cQ76I25 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Higd1cQ76I25 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Higd1cQ76I25 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Higd1cQ76I25 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Higd1cQ76I25 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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