Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI8

Cxxc4, CXXC-type zinc finger protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc4Q6NXI8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cxxc4Q6NXI8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxxc4Q6NXI8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxxc4Q6NXI8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms