Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntn4Q69Z26 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntn4Q69Z26 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms