Protein–RNA interactions for Protein: Q68FF6

Git1, ARF GTPase-activating protein GIT1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Git1Q68FF6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Git1Q68FF6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Git1Q68FF6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Git1Q68FF6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Git1Q68FF6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Git1Q68FF6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Git1Q68FF6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Git1Q68FF6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms