Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ss18Q62280 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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